坚决维护北大的尊严，拒绝容许伪校伪组织的人进入北大校园。
在解决教职员难题的同时，傅斯年这个暂代校长，也拼尽全力，为北大争取到新校地、校产，目的自然是为“断然不愿与别人抢东西”的胡适开路。
在以后的短短半年中，他还争取到北大周围的许多敌伪房产和无主民房，其中包括相公府、东厂胡同的黎元洪故居、旧国会大厦等建筑。
他在致敌伪产业处理局等部门的公函中称：“查本校复员在即，需用房屋至为迫切。兹将邻近本校之敌伪房产地址开具清单，敬希惠察，允将单列各处暂为拨借应用，或订价购置以济急需。”
在致河北平津区敌伪产业处理局的公函中称：“查中老胡同三十二号房舍系敌伪产业，经交通部平津区特派员办公处拨交敝校应用业已接收清楚，相应函达查照，即请赐予备案。”在致李宗仁、**崎、熊斌的电报中称：“本校校址不敷亟等购置民房，拟请将后门、沙滩、马神庙、南北池子、皇城根、南夹道、南河沿一带及西四至西单间之敌伪房产尽先拨归本校价购以资应用。”
据陈雪屏回忆，傅斯年经常对他说：“关于行政上的业务，我们应先替胡先生办好，将来不劳他操心，即以校产为言，他断不愿和别人抢东西的。”
在担任代理校长的过程中，傅斯年还不遗余力建学院充师资。将北大由原来的文理法三个学院，扩展为文理法农工医六个学院，建立文科研究所，在文学院成立东方语文学系。北大成为门类齐全的综合性大学，成形于傅斯年之手。
又聘任陈寅恪、汤用彤、饶毓泰、俞大绂、朱光潜、季羡林等一批学术大师，北大迁往南方的图书资料和其它设施也抓紧运回。
清华、北大执中国教育之牛耳，亲如手足，竞如对手。外界常将两校并列，各有千秋，难分轩轾。但本校学生向来当仁不让，母校永远争第一，相互较劲、相互消遣的段子也层出不穷。如同英国之牛津、剑桥，美国之哈佛、耶鲁
对外护校心切，暗中与清华叫板。傅斯年“北大长子”的母校情结，在复校扩院时多处流露。
三校合并西南联大之时，清华实力最强，师多、生多、钱多、物（设备）多，清华校长梅贻琦实际主持联大校务，公正厚道，井井有条，威望极高。
前边提到过，对以“最高学府”自居的北大而言，却有一种“寄人篱下”的心理折磨。北大一些教授对时任校长蒋梦麟不满，认为他没有在联大中争夺更多话语权，没有足够维护北
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